Quando a proteína é extraída de células quebradas, podem ser liberadas proteases, que precisam ser rapidamente inibidas para evitar que a proteína seja degradada. No processo de extração de proteínas, é necessário adicionar inibidores de protease para prevenir a proteólise. Inibidor de protease refere-se amplamente a uma substância que se liga a alguns grupos no centro ativo das moléculas de protease, de modo que a atividade da protease diminui ou mesmo desaparece, mas não desnatura a proteína enzimática. A sensibilidade de várias proteases a diferentes proteínas é diferente, por isso é necessário ajustar a concentração de várias proteases. Como a solubilidade do inibidor de protease em líquido é extremamente baixa, deve-se prestar atenção especial ao fato de que o inibidor de protease deve ser totalmente misturado no tampão para reduzir a precipitação do inibidor de protease. A Pepstantina A pode inibir proteases ácidas como pepsina, angiotensina, colagenase, catepsina D e quimosina.
